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SCANPY: large-scale single-cell gene expression data analysis
F. Alexander Wolf, Philipp Angerer, Fabian J. Theis · Genome biology · 2018년 · 조회 18
왜 이 논문인가 — 선정 기준
RESEARCH PAPER · 후속 연구설계에 활용하기 좋은 논문 — 척도·모형·프레임워크류, 피인용 다수
2018-02 발표 · 피인용 9,759회 · 분야 내 인용 영향력 상위권 · 동년 인용 상위 1% · 참고문헌 55개
9759회 인용으로 분야 평균 대비 매우 높은 인용 영향을 갖고, 2018년 발표 논문 중 상위 1%에 속해 RESEARCH PAPER 슬롯에 선정되었습니다.
논문 요약
SCANPY는 단일세포 유전자 발현 데이터를 대규모로 분석하기 위한 툴킷으로, 전처리·시각화·클러스터링·유사시간·경로 추론·차등 발현 검정·유전자 조절망 시뮬레이션 기능을 제공한다. 파이썬 기반 구현으로 100만 개 이상의 세포 데이터를 효율적으로 처리한다. 또한, 주석이 달린 데이터 매트릭스를 다루는 범용 클래스인 AnnData를 함께 제공한다. 해당 툴은 GitHub를 통해 오픈소스로 배포된다.
후속 연구설계에 활용하기
대규모 단일세포 데이터 분석 시 SCANPY와 AnnData를 사용해 데이터 전처리부터 클러스터링·경로 분석까지 일관된 파이프라인을 구축할 수 있다.
핵심어
단일세포유전자발현데이터분석파이썬툴킷
실존 확인
이 논문은 OpenAlex에서 후보로 수집한 뒤, Crossref에 등록된 DOI와 제목 일치를 확인해 노출합니다.
SSRA가 문헌연구에서 인용 논문의 실재 여부를 검증하는 원칙과 같습니다.